조 전 장관은 딸의 장학금 수혜 논란과 고교생 인턴·체험활동 확인서의 허위 여부 대해서도 해명했다. 조 전 장관의 딸은 부산대학교 의학전문대학원을 다니며 지도교수인 노환중 원장의 개인 장학재단인 소천장학금을 지급받으며 ‘황제 장학금’ 논란이 일었다. 조 전 장관은 책 속에서 “장학금을 대가로 노 원장이 대통령 주치의로 선정됐다는 건 허무맹랑한 보도”라며 “대통령 주치의는 대통령 비서실장의 소관 사안이라는 점을 청와대가 밝혔다”고 말했다. 노 원장이 딸에게 장학금을 지급한건 “지도학생이 좌절하는 것을 막고 힘을 복돋아주기 위해 준 것”이라고 선을 그었다.
고교생 인턴·체험활동 확인서 허위여부에 대해 그는 “10년 전 고교생 인턴·페험활동은 엄격한 관리와 점검 체제 없이 운영됐다”며 “당시는 프로그램 실제 운영이 기관별로 천차만별이었는데, 오랜 세월이 지나 검찰이 형사처벌을 위한 현미경과 칼날을 들이댔다”고 주장했다. 딸이 저자로 등재된 공주대 연구물에 대해서도 2019년 12월 공주대 연구윤리위원회에서 문제가 없다고 결론 내린점을 다시 한번 밝혔다. 다만 조 전 장관은 논란이 됐던 정 교수의 동양대 표창장 위조 혐의에 대해서는 구체적으로 언급하지 않았다.
조 전 장관의 동생이 유죄 판결을 받은 웅동학원 교사 채용 비리를 두고는 “경제적 사정이 어려워지다 보니, 채용 브로커의 유혹에 빠졌던 모양이다”며 “이 점에 대해 깊이 반성하고 있다”고 그를 대변했다. 그러면서도 그는 “가족은 웅동학원을 통해 이익을 얻기는 커녕 막대한 피해를 입었고, 채무를 인수한 캠코는 원금 9억 5000만원에 19%라는 고율의 이자를 붙여 신용 불량자가 된 동생은 사업을 하는데 지장을 받았다”고 호소했다. 또 9억 5000만원 가량의 웅동학원 연대 보증 의혹에 대해서도 “당시 유학중이어서 내가 관여한 일은 전혀 없고, 사안에 대해 구체적으로 알게 된건 IMF 이후”라고 강조했다.